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El CLEMI se encuentra ubicado sobre el kilómetro 16 de la Autopista Norte a 500 metros de la hacienda presidencial Hato Grande y en el cruce a la entrada a clubes, sobre una extensión de 21.000 metros cuadrados, haciéndolo por sus dimensiones y connotaciones locativas, tecnológicas y geográficas único en su género en América Latina. 
El centro cuenta con instalaciones que responde alas necesidades planteadas así:
ÁREA DE ENTRENAMIENTO PROFESIONAL QUIRÚRGICO: El CLEMI cuenta con un área quirúrgica de 3000 metros cuadrados, con modernas instalaciones y equipos de simulación donde se realizan entrenamientos (protocolos de investigación) en componentes anatómicos y modelos experimentales.
Las salas de entrenamiento cuentan con un sistema de irrigación, succión, equipos de simulación, videoendoscopia quirúrgica, eltrocoagulación, radiofrecuencia, intensificador de imagenes, motores quirúrgicos y microscopios acompañados de los diferentes set de instrumental para cada una de las especialidades. Un bioterio que permite garantizar adecuado cuidado y manejo de los animales de laboratorio y experimentación cumpliendo así con la normaticidad vigente; una morgue que permite la adecuada conservación de componentes anatómicos y 2 auditorios con capacidad para 200 personas. ÁREA DE ENTRENAMIENTO NO QUIRÚRGICO
Con el fin de proporcionar a los participantes las mejores condiciones que contribuyan al aprendizaje, el centro contará con 8 auditorios con capacidad para 50 personas cada uno, los cuales se podrá integrar en salones para 100 personas. Contará además con un área de exhibición científica con capacidad para 20 stands de 3x2 mts y 35 stands de 2x2 mts; estas salas estarán dotadas con servicio de video conferencias, plataforma Web, traducción simultánea, conferencias en vivo, cirugías en vivo y circuito cerrado de televisión. ÁREA EMPRESARIAL
Contará con 24 oficinas administrativas, 2 salas de Juntas, 2 áreas de recepción, una oficina de la ACSC (Asociación Colombiana de Sociedades Científicas), todo esto acompañado de la más avanzada tecnología en telecomunicaciones. Permitiendo ofrecer un servicio integral de parte del personal de la institución. ÁREA HOTELERA Contará con área hotelera adecuada a las necesidades de os asistentes al Centro.
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